The Almighty​ Curcumin

Curcumin is a polyphenol derived from the root of turmeric (Curcuma longa) that it is widely used as a dietary spice and natural food colouring agent throughout the world.

Figure 1: Turmeric plant. source: Franz Eugen Köhler, Köhler’s Medizinal-Pflanzen
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The Taylor Series

The Taylor series is a mathematical tool that, sometimes, it is not easy to immediately grasp by freshman students. In this blog, I will give a short review of it giving some examples of applications.

Who is Mr. Taylor?

Brook Taylor (1685 – 1731) was a 17th-century British mathematician. He demonstrated the celebrated Taylor formula, the topics of this blog, in his masterwork Methodus Incrementorum Directa et Inversa (1715). For more information, just give a read to the following wiki page.

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Modelling Natural Pattens and Forms I: Sunflowers Florets and the Golden Ratio

Il girasole piega a occidente
e già precipita il giorno nel suo
occhio in rovina … 
from the poem  “Quasi un madrigale” by Salvatore Quasimodo.

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Il Guscio di una Chiocciola Ciociara e la sua Digitalizazione 3D con l’algoritmo Structure-from-Motion

Viva la Chiocciola,
viva una bestia
che unisce il merito
alla modestia.
Essa all’astronomo
e all’architetto
forse nell’animo
destò il concetto
del cannocchiale
e delle scale:
viva la Chiocciola
caro animale…

La Chiocciola di Giuseppe Giusti (1847)

Introduzione

La bella poesia del Giusti esprime la piacevole simpatia che infonde questo piccolo abitante dei nostri giardini. Sono sempre stato affascinato da questo gasteropode, tanto che è stato uno degli invertebrati favoriti per le mie giovanili osservazioni naturalistiche amatoriali. Inoltre, ricordo ancora con piacere e nostalgia la raccolta di quelle chiamate in dialetto ciociaro ‘ciammaruchelle‘, ovvero delle chiocciole piccoline. Queste si raccoglievano a manciate nei campi di grano dopo la mietitura. Era una delle varie tradizioni culinarie che coinvolgevano ogni anno tutta la mia famiglia e venivano portate a termine con assidua devozione. La raccolta veniva organizzata con un’accurata scelta di tempi, luoghi e condizioni meteorologiche per aumentare la probabilità di successo. Solitamente si tornava a casa con un ricco e gustoso bottino, ma non senza patimenti, visto che le piccole lumache si arrampicavano sulle piante di cardo (Cynara cardunculus L., 1753) dove si nascondevano tra le spine per proteggersi dai predatori. Per loro sfortuna, il predatore Homo Sapiens Sapiens Frusinenses, dotato di vista acuta e grande tenacia, non mollava facilmente la sua preda!

La specie raccolta era varietà della chiocciola Eobania vermiculata o “rigatella”, molto comune nelle regioni mediterranee. Le ciammaruchelle venirano raccolte in ceste di vimini e una volta tornati a casa, venivano rinchiuse dentro gabbie circolari con pareti di rete a piccole maglie per vari giorni per spurgarne l’intestino del contenuto. Venivano quindi cucinate per qualche ora in un sugetto di pomodoro speziato con mentuccia (Clinopodium nepeta) con una ricetta di origini antiche. Il piatto veniva poi consumato con pane fresco o meglio infornato per renderlo croccante. Una sonora festa di profumi, sapori e colori: il suono dei risucchi nel tentativo di svuotare i gusci del loro succulento contenuto. Una delicata festa di odori e sapori: il profumo del pomodoro aromatizzato dalla carne della chiocciola e dalla mentuccia, combinato con il suo colore rosso variagato dalle striature bianco-marroncino del guscio delle ciammaruchelle.

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Physical Chemistry: The Simple Hückel Method (Part I)

The Hückel molecular orbital method is a quantum mechanics approach for calculating the energies of molecular orbitals of π electrons in conjugated hydrocarbon systems, such as ethylene, benzene, and butadiene. In this series of articles, I have summarized the main aspects of the theory with practical examples of applications and programming of the method.

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Retro Programming II: the Amiga and the Computational Beauty of the Leaf

In my archaeological exploration of old computer files, I came across another simple but exciting Amiga Basic program I programmed in 1989. It is named “Foglie”, the Italian name for leaves. It was an attempt to explore some ideas of functional plant morphology modelling. The stimulus comes after the reading of the paper by Karl J. Niklas on issue 213 of Le Science (the Italian edition of the Scientific American magazine [1]). The article titled “Computer-simulated plant evolution” described the modelling of plants to study their interaction with the environment. It was a fascinating paper; still, simple and primitive graphics caught my imagination. Nowadays, the field of digital morphology has come to an age (just to mention one, Avatar), and we can have an idea of this progress in the level of realism in movies, video games, and TV programs. However, the organism’s form and shape have always caught my curiosity and interest. The structure of leaf nervation was an intriguing pattern related to my acquaintance with the fascinating fractals objects, another recurrent topic in the pages of scientific magazines of the period.

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Modular Assembly of Proteins on Nanoparticles

I have recently contributed to a proof of concept study published in the prestigious Nature Communication (doi:10.1038/s41467-018-03931-4) [1]. The study involved collaborations with experimental groups across the University of Lincoln (UoL), University of Molise (Italy) and the Royal Holloway University of London coordinated by Dr Enrico Ferrari (UoL).

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The Protein Engineering of a controllable Nano-Gate: the FhuA D1– 160 channel

The confinement of primeval biochemical compounds by nano compartmentalization made possible the spatial and temporal control and the development possible the most complex chemical process: the life. Continue reading